ベースクロックとは、CPUやGPUなどの「通常時のクロック周波数」のことです。
最近のCPUやGPUは、低負荷時は低クロックになったり、高負荷時は高クロックになったりしますが、「ちょいと中負荷のときのクロック」はベースクロックと呼ばれます。
低負荷時はベースクロックよりさらに下がったりします。