Quake III Arenaでは前作までは豊富にあった「フィールドに落ちてるアイテム」の概念がほぼ無くなり、「[[マウス]]捌きを競う」という要素が極端に強くなった。つまり運では勝てないような調整となっている。このため発売から20年以上経過した今でもゲーム大会(通称:[[eスポーツ]])が開かれるほどである。
また、操作面ではストラフジャンプやロケットジャンプなどが追加されている。また、操作面では[[ストレイフジャンプ]]や[[アクセルジャンプ]]や[[ロケットジャンプ]]などが追加されている。
視野角やテクスチャの詳細、敵のモデルなどを幅広くカスタマイズできる。